Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndst2P52850 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndst2P52850 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndst2P52850 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndst2P52850 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst2P52850 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndst2P52850 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst2P52850 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst2P52850 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndst2P52850 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndst2P52850 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms