Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr7P47774 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr7P47774 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr7P47774 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr7P47774 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr7P47774 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms