Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tjp1P39447 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tjp1P39447 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tjp1P39447 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tjp1P39447 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Tjp1P39447 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms