Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox5P35710 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox5P35710 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox5P35710 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox5P35710 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox5P35710 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox5P35710 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox5P35710 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox5P35710 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox5P35710 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox5P35710 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms