Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb1aP21447 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Abcb1aP21447 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcb1aP21447 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcb1aP21447 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcb1aP21447 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcb1aP21447 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcb1aP21447 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcb1aP21447 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcb1aP21447 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms