Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxcl1P12850 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxcl1P12850 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcl1P12850 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl1P12850 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl1P12850 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms