Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm1P0DP26 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calm1P0DP26 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calm1P0DP26 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm1P0DP26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calm1P0DP26 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms