Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01674 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01674 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01674 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01674 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01674 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01674 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01674 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01674 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01674 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01674 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01674 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01674 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01674 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01674 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01674 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01674 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01674 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01674 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01674 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01674 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01674 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01674 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01674 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01674 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01674 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01674 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01674 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01674 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01674 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01674 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01674 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01674 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01674 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01674 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01674 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01674 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01674 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01674 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01674 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01674 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01674 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01674 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01674 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01674 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms