Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops3O88543 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cops3O88543 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops3O88543 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cops3O88543 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cops3O88543 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cops3O88543 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cops3O88543 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cops3O88543 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cops3O88543 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cops3O88543 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cops3O88543 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cops3O88543 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms