Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pja1O55176 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja1O55176 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja1O55176 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pja1O55176 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pja1O55176 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja1O55176 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pja1O55176 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pja1O55176 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pja1O55176 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pja1O55176 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja1O55176 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja1O55176 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pja1O55176 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms