Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syngr2O55101 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngr2O55101 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms