Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf12O35738 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf12O35738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf12O35738 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf12O35738 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf12O35738 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf12O35738 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf12O35738 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf12O35738 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf12O35738 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms