Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna3O35344 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna3O35344 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kpna3O35344 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kpna3O35344 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms