Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Kpna3O35344 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kpna3O35344 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kpna3O35344 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kpna3O35344 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kpna3O35344 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Kpna3O35344 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kpna3O35344 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Kpna3O35344 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Kpna3O35344 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Kpna3O35344 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Kpna3O35344 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kpna3O35344 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Kpna3O35344 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kpna3O35344 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Kpna3O35344 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Kpna3O35344 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kpna3O35344 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kpna3O35344 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kpna3O35344 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Kpna3O35344 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Kpna3O35344 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kpna3O35344 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kpna3O35344 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kpna3O35344 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kpna3O35344 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kpna3O35344 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kpna3O35344 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kpna3O35344 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kpna3O35344 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Kpna3O35344 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kpna3O35344 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kpna3O35344 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kpna3O35344 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kpna3O35344 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kpna3O35344 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kpna3O35344 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kpna3O35344 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kpna3O35344 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kpna3O35344 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kpna3O35344 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kpna3O35344 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kpna3O35344 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kpna3O35344 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Kpna3O35344 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kpna3O35344 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kpna3O35344 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kpna3O35344 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kpna3O35344 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kpna3O35344 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kpna3O35344 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kpna3O35344 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kpna3O35344 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kpna3O35344 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Kpna3O35344 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kpna3O35344 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Kpna3O35344 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kpna3O35344 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kpna3O35344 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kpna3O35344 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kpna3O35344 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kpna3O35344 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kpna3O35344 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kpna3O35344 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kpna3O35344 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kpna3O35344 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kpna3O35344 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kpna3O35344 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kpna3O35344 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Kpna3O35344 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kpna3O35344 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kpna3O35344 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kpna3O35344 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kpna3O35344 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kpna3O35344 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kpna3O35344 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kpna3O35344 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kpna3O35344 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kpna3O35344 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kpna3O35344 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kpna3O35344 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kpna3O35344 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kpna3O35344 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kpna3O35344 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kpna3O35344 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kpna3O35344 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kpna3O35344 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kpna3O35344 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kpna3O35344 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kpna3O35344 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kpna3O35344 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kpna3O35344 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kpna3O35344 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kpna3O35344 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kpna3O35344 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kpna3O35344 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kpna3O35344 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kpna3O35344 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kpna3O35344 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kpna3O35344 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms