Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kif1cO35071 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kif1cO35071 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kif1cO35071 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kif1cO35071 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kif1cO35071 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.9 ms