Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube3aO08759 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube3aO08759 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3aO08759 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ube3aO08759 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ube3aO08759 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms