Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17093F6XGJ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm17093F6XGJ4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17093F6XGJ4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17093F6XGJ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms