Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8237E9Q257 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8237E9Q257 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm8237E9Q257 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8237E9Q257 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms