Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ldlrad1D3YYZ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ldlrad1D3YYZ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ldlrad1D3YYZ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ldlrad1D3YYZ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ldlrad1D3YYZ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ldlrad1D3YYZ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms