Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smok3bC0HKC9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smok3bC0HKC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smok3bC0HKC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smok3bC0HKC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms