Protein–RNA interactions for Protein: A2ATJ4

Olfr1200, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr1200A2ATJ4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Olfr1200A2ATJ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Olfr1200A2ATJ4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Olfr1200A2ATJ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Olfr1200A2ATJ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms