Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CerklA2AQH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CerklA2AQH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CerklA2AQH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CerklA2AQH1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CerklA2AQH1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms