RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 MR1Q95460 341 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LRFN5Q96NI6 719 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 BIRC8Q96P09 236 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINB12Q96P63 405 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RUFY1Q96T51 708 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TCF12Q99081 682 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM117AQ9C073 453 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEB16A2A368 324 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC14CA4D256 554 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FURINP09958 794 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ITGA1P56199 1179 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KIR2DS3Q14952 304 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ZIC1Q15915 447 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NEPROQ6NW34 567 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TCTN2Q96GX1 697 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 IL17FQ96PD4 163 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR87Q9BY21 358 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ACTL8Q9H568 366 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM60AQ9NP50 221 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 POLHQ9Y253 713 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 USP27XA6NNY8 438 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 E7EQ34 232 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BMM5 538 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MEN1O00255 615 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NIPSNAP2O75323 286 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RECKO95980 971 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ESR1P03372 595 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CD9P21926 228 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPN4P29074 926 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GRB7Q14451 532 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R7Q15435 360 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC23LQ6PF05 361 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CENPUQ71F23 418 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR135Q8IZ08 494 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 DSELQ8IZU8 1212 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM136AQ96C01 138 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MENTQ9BUN1 341 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CHST8Q9H2A9 424 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NFS1Q9Y697 457 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MED13Q9UHV7 2174 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP46Q8IYW2 2715 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC28A2O43868 658 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 CHRM3P20309 590 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 RORAP35398 523 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEA3P43357 314 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 BDKRB1P46663 353 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 ADARP55265 1226 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 NFKB2Q00653 900 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 LCN10Q6JVE6 187 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM135Q86UB9 458 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC14L1Q92503 715 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 FOPNLQ96NB1 174 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-211ENST00000493436 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms