RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 TMEM220Q6QAJ8 160 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 SH2D5Q6ZV89 423 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 CMC1Q7Z7K0 106 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 SPACA3Q8IXA5 215 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 TSSK1BQ9BXA7 367 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 LATS2Q9NRM7 1088 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 SENP1Q9P0U3 644 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 KLHL42Q9P2K6 505 aa17.83■□□□□ 0.45
PTX4-201ENST00000293922 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 OR2AG2A6NM03 316 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 E5RI56 91 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 FTH1P02794 183 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GSTM1P09488 218 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CHRM3P20309 590 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SAT1P21673 171 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GSTM4Q03013 218 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 BIRC2Q13490 618 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 TTMPQ5BVD1 217 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 UGT3A1Q6NUS8 523 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 USP53Q70EK8 1073 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CCDC91Q7Z6B0 441 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CLEC14AQ86T13 490 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PIM3Q86V86 326 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KRT222Q8N1A0 295 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 FBXO39Q8N4B4 442 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GPR21Q99679 349 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 NUDT22Q9BRQ3 303 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 MED4Q9NPJ6 270 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.82■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 C2P06681 752 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SLC35E2BP0CK96 405 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 HGFP14210 728 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CCNFP41002 786 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 IYDQ6PHW0 289 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 C11orf96Q7Z7L8 435 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 LRRTM4Q86VH4 590 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 EXOC3L1Q86VI1 746 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GIMAP7Q8NHV1 300 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CD200R1Q8TD46 325 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CABS1Q96KC9 395 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GALPQ9UBC7 116 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 DHRS7Q9Y394 339 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 LOXL2Q9Y4K0 774 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 A0A096LPK6 155 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZW10O43264 779 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PYGBP11216 843 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 F3P13726 295 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KRT4P19013 534 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CCR7P32248 378 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CLCNKAP51800 687 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PGGT1BP53609 377 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CFHR1Q03591 330 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SLC18A2Q05940 514 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GPS2Q13227 327 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SQSTM1Q13501 440 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF460Q14592 562 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 NKAIN2Q5VXU1 208 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CRTC3Q6UUV7 619 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 FAM136AQ96C01 138 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SLC30A3Q99726 388 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 CCM2Q9BSQ5 444 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 GPAMQ9HCL2 828 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KLC4Q9NSK0 619 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KCNK4Q9NYG8 393 aa17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 A0A087X1B8 175 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KLHL33A6NCF5 533 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 PRR19A6NJB7 356 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 AGRPO00253 132 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KPNA5O15131 536 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 KMOO15229 486 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 SNX2O60749 519 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 ITGB6P18564 788 aa17.8■□□□□ 0.44
PTX4-201ENST00000293922 AOAHP28039 575 aa17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms