RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	RASGRP1	O95267	797 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	RPN2	P04844	631 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	GFAP	P14136	432 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	BCKDHB	P21953	392 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD17B2	P37059	387 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PREP	P48147	710 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	FNTB	P49356	437 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	HK2	P52789	917 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ABR	Q12979	859 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	RCN2	Q14257	317 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ALG11	Q2TAA5	492 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC50	Q53HI1	259 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	LSMEM2	Q8N112	164 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	STON2	Q8WXE9	905 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SORT1	Q99523	831 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	KLC4	Q9NSK0	619 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CD274	Q9NZQ7	290 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	TAPBP	O15533	448 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SUPT3H	O75486	399 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT1	P04628	370 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	DPP6	P42658	865 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	GNPDA1	P46926	289 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKAA1	Q13131	559 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PMS2CL	Q68D20	193 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PARG	Q86W56	976 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF21B	Q96EK2	531 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A18	Q96N87	628 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM237	Q96Q45	408 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	MYOC	Q99972	504 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CD244	Q9BZW8	370 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL15	Q9NXU5	204 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	POLG2	Q9UHN1	485 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	INVS	Q9Y283	1065 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529		A6NCN8	305 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5K4	A6NMS3	321 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	MEI4	A8MW99	385 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	E2F3	O00716	465 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ITM2A	O43736	263 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX3	O60493	162 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	STK16	O75716	305 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	MLYCD	O95822	493 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	CSF2	P04141	144 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ACP5	P13686	325 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	NDUFS1	P28331	727 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	ARRB2	P32121	409 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXD12	P35452	270 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A12	P48065	614 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TRAF4-208	ENST00000469529	PIK3CG	P48736	1102 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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