RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271877.11

UBAP2L-201, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBAP2L, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-201ENST00000271877 TRIM54Q9BYV2 358 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 CCSER2Q9H7U1 834 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 RGS18Q9NS28 235 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TLK1Q9UKI8 766 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 NCAM2O15394 837 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 COG7P83436 770 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ARF5P84085 180 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 COQ5Q5HYK3 327 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 GLYATQ6IB77 296 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 C19orf48Q6RUI8 117 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 LINC00523Q86TU6 105 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 NLRP8Q86W28 1048 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 OR4F6Q8NGB9 312 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 FGF11Q92914 225 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 C7orf34Q96L11 122 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SLC6A18Q96N87 628 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 VAT1Q99536 393 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 DGCR6LQ9BY27 220 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 FAM105AQ9NUU6 356 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 H0YAE9 185 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 PRKD3O94806 890 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 PARNO95453 639 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ESRRBO95718 433 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 IDO1P14902 403 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 CCR1P32246 355 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 STX5Q13190 355 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SEPT6Q14141 434 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ATCAYQ86WG3 371 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 CLIP4Q8N3C7 705 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TTC30BQ8N4P2 665 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 FATE1Q969F0 183 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 RNF145Q96MT1 663 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 GIT1Q9Y2X7 761 aa10□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SLC16A6O15403 523 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ETHE1O95571 254 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 JUNDP17535 347 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ATF6P18850 670 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MTHFRP42898 656 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 CREMQ03060 361 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MPEG1Q2M385 716 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 OR10A6Q8NH74 314 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SNX25Q9H3E2 840 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SEMG2Q02383 582 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 LCP2Q13094 533 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 DAG1Q14118 895 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MFSD10Q14728 455 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 VRK3Q8IV63 474 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MIER2Q8N344 545 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 DERL2Q9GZP9 239 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 OR2A25A4D2G3 310 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 GFRA2O00451 464 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 SGTAO43765 313 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 FZD6O60353 706 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 TLR5O60602 858 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 FMO4P31512 558 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 BFSP2Q13515 415 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MAP7Q14244 749 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 USP43Q70EL4 1123 aa9.99□□□□□ -0.81
UBAP2L-201ENST00000271877 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms