RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC19A1	P41440	591 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	RGS4	P49798	205 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	IL2	P60568	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	RPE65	Q16518	533 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MZB1	Q8WU39	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MTBP	Q96DY7	904 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PPCS	Q9HAB8	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ASF1A	Q9Y294	204 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A096LPK6	155 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	RFPL1	O75677	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TSPAN12	O95859	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ACADL	P28330	430 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CRABP2	P29373	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	GRK6	P43250	576 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	DLG1	Q12959	904 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PRKG2	Q13237	762 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CSHL1	Q14406	222 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	HDX	Q7Z353	690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	SFRP1	Q8N474	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MAPK15	Q8TD08	544 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	APOLD1	Q96LR9	279 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TLK1	Q9UKI8	766 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	FLRT2	O43155	660 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MT-ND3	P03897	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CBSL	P0DN79	551 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CBS	P35520	551 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MAGEA12	P43365	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	BDKRB1	P46663	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC14A1	Q13336	389 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT33B	Q14525	404 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	NAXD	Q8IW45	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	GPR156	Q8NFN8	814 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ISL2	Q96A47	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	NRTN	Q99748	197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF358	Q9NW07	568 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	ACOT9	Q9Y305	439 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PCM1	Q15154	2024 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0G2JNG1	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	OR5K4	A6NMS3	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CDC7	O00311	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	VIP	P01282	170 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	MPC1L	P0DKB6	136 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	PYGB	P11216	843 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC2A4	P14672	509 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	CSRP3	P50461	194 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	HHEX	Q03014	270 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SUMO3-206	ENST00000479153	BIRC2	Q13490	618 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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