RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 KCNN1Q92952 543 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 OMDQ99983 421 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 ADAM12O43184 909 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 IFNA17P01571 189 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 AMHP03971 560 aa6.37□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.37□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 IFT27Q9BW83 186 aa6.37□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.37□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 HERVK_113P63132 956 aa6.37□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 TBX22Q9Y458 520 aa6.36□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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SBNO1-202ENST00000420886 CCNB2O95067 398 aa6.36□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 OTCP00480 354 aa6.36□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 F9P00740 461 aa6.36□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 ACADLP28330 430 aa6.36□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 PTGR1Q14914 329 aa6.36□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 BAK1Q16611 211 aa6.36□□□□□ -1.39
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL26Q53HC5 615 aa6.36□□□□□ -1.39
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