RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421750.1

TRAPPC2P4-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC2P4, Length 331 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AKNAQ7Z591 1439 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GSAPA4D1B5 854 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GOLGA8OA6NCC3 632 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DRGXA6NNA5 263 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KLRF2D3W0D1 207 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GOLGA8NF8WBI6 632 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PSMD9O00233 223 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ABLIM1O14639 778 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CETN3O15182 167 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STC2O76061 302 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RHOBTB1O94844 696 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GLCEO94923 617 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IL1BP01584 269 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HOXB5P09067 269 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CALCBP10092 127 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CYP11B2P19099 503 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 UGT1A6P19224 532 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PSMB4P28070 264 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ACADLP28330 430 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TYK2P29597 1187 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PKLRP30613 574 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AKT2P31751 481 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MCM5P33992 734 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC6A12P48065 614 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AGTR2P50052 363 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HTR6P50406 440 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CHN2P52757 468 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OAZ1P54368 228 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RRADP55042 308 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC37A1P57057 533 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CARD18P57730 90 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TAS2R40P59535 323 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PPP2R2BQ00005 443 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RESTQ13127 1097 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CDO1Q16878 200 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KCTD11Q693B1 232 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RANBP10Q6VN20 620 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DOK3Q7L591 496 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NEK8Q86SG6 692 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SIAH3Q8IW03 269 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TTLL6Q8N841 843 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RAD54LQ92698 747 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RIT1Q92963 219 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC25A28Q96A46 364 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NRBF2Q96F24 287 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 COQ10AQ96MF6 247 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LRRC3BQ96PB8 259 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PNKPQ96T60 521 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPHA2Q96T91 129 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LZTS2Q9BRK4 669 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR10A2Q9H208 303 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PANK4Q9NVE7 773 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARL15Q9NXU5 204 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms