RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421750.1

TRAPPC2P4-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC2P4, Length 331 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR6C68A6NDL8 312 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STMND1H3BQB6 276 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRIM77I1YAP6 450 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PPP6CO00743 305 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CTDSPLO15194 276 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MED7O43513 233 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DAB1O75553 588 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SUN1O94901 812 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZNF202O95125 648 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CH25HO95992 272 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SERPINC1P01008 464 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ERBB2P04626 1255 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HIST1H2ABP04908 130 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CYP1A2P05177 515 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HLA-DOAP06340 250 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PGK2P07205 417 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CLUP10909 449 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZNF20P17024 532 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IGFBP2P18065 325 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HIST1H2ADP20671 130 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CALB2P22676 271 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 VIPR1P32241 457 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CDKN1AP38936 164 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARHGAP25P42331 645 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ETV4P43268 484 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MAPKAPK2P49137 400 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PEX5P50542 639 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CDR1P51861 262 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ACTR3P61158 418 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPC5P78333 572 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SHC2P98077 582 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MC2RQ01718 297 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRDNQ13061 729 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DNASE1L3Q13609 305 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NEDD9Q14511 834 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 UGCGQ16739 394 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 USP41Q3LFD5 358 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CDONQ4KMG0 1287 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GAGE13Q4V321 117 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARSKQ6UWY0 536 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SCAIQ8N9R8 606 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR2T3Q8NH03 318 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR8K3Q8NH51 312 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LPPQ93052 612 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AZIN2Q96A70 460 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NACC2Q96BF6 587 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DHX58Q96C10 678 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PHF21BQ96EK2 531 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PANX3Q96QZ0 392 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PCYT2Q99447 389 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GON7Q9BXV9 100 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 XKR8Q9H6D3 395 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KLHL1Q9NR64 748 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NCAPD2Q15021 1401 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.4 ms