RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409915.8

SF3B1-202, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF3B1, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-202ENST00000409915 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 GCNT4Q9P109 453 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MUTYHQ9UIF7 546 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KCND3Q9UK17 655 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CDH9Q9ULB4 789 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.56□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 NCANO14594 1321 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 URADA6NGE7 173 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KCNJ18B7U540 433 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 H0YC42 278 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 UBXN8O00124 270 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 AP3B1O00203 1094 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MATN2O00339 956 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KRIT1O00522 736 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 PGRMC2O15173 223 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KMOO15229 486 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 TSC22D2O75157 780 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MOSPD3O75425 235 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 PALMO75781 387 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 GNA14O95837 355 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 OLFM2O95897 454 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 TPOP07202 933 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SAT1P21673 171 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 GABRR2P28476 465 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 HOXA9P31269 272 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.683e-11■■■□□ 17
SF3B1-202ENST00000409915 ALDH1A3P47895 512 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SLC6A9P48067 706 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KLK7P49862 253 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SULT1E1P49888 294 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 EPHB3P54753 998 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 STARD6P59095 220 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MYL5Q02045 173 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ROM1Q03395 351 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 INCA1Q0VD86 236 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 RPA4Q13156 261 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SGCGQ13326 291 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CUL2Q13617 745 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KCNJ12Q14500 433 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ITIH4Q14624 930 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 VEPH1Q14D04 833 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 TEAD2Q15562 447 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MIIPQ5JXC2 388 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MPP7Q5T2T1 576 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 FAM171BQ6P995 826 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 EMBQ6PCB8 327 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 Q6ZNX1 250 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CEP128Q6ZU80 1094 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 TMC8Q8IU68 726 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 VSTM4Q8IW00 320 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 IQCKQ8N0W5 287 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ELMOD1Q8N336 334 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CCDC63Q8NA47 563 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 GPR156Q8NFN8 814 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 FIBINQ8TAL6 211 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 LMO3Q8TAP4 145 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CEP76Q8TAP6 659 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 IFI44Q8TCB0 444 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 DYDC1Q8WWB3 177 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 CPT1BQ92523 772 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 RSC1A1Q92681 617 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 GATA6Q92908 595 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 FGF13Q92913 245 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 PANX2Q96RD6 677 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KCNK16Q96T55 309 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 KXD1Q9BQD3 176 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SF3B1-202ENST00000409915 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.55□□□□□ -1.68
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