RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF398Q8TD17 642 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 NCSTNQ92542 709 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC45Q96CN5 670 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SDK2Q58EX2 2172 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR19A6NJB7 356 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP6O43182 974 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CRTAMO95727 393 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 VIPP01282 170 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC19A1P41440 591 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 CTSCP53634 463 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 GDF10P55107 478 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE1BQ01064 536 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 SMOXQ9NWM0 555 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 NBEAQ8NFP9 2946 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-211ENST00000493436 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 BPTFQ12830 3046 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 LILRA5A6NI73 299 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 OR2AG2A6NM03 316 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf172C9J069 976 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNJ13O60928 360 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 METTL18O95568 372 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 BRAFP15056 766 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 MSH3P20585 1137 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 AKT1P31749 480 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 KCTD11Q693B1 232 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 AMZ2Q86W34 360 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ASB8Q9H765 288 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 UCK1Q9HA47 277 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PDP2Q9P2J9 529 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 A8MU76 341 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 LIPCP11150 499 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TMPRSS15P98073 1019 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 XIAPP98170 497 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 VAC14Q08AM6 782 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TGIF1Q15583 401 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 P3H1Q32P28 736 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 DET1Q7L5Y6 550 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM129CQ86XR2 697 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ART4Q93070 314 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TAAR9Q96RI9 348 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 POT1Q9NUX5 634 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB7A8K855 629 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PSMD3O43242 534 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 TPH1P17752 444 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 CD82P27701 267 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 HADHAP40939 763 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 HALP42357 657 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 DMPKQ09013 629 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 CLCA4Q14CN2 919 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS6KA1Q15418 735 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms