RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 ARL5AQ9Y689 179 aa22.7■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 IGSF10Q6WRI0 2623 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 KMOO15229 486 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PRAMEF10O60809 474 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GPLD1P80108 840 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 BROXQ5VW32 411 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 HES6Q96HZ4 224 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 FOXJ2Q9P0K8 574 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 KCTD3Q9Y597 815 aa22.69■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 A0A0G2JNG1 304 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 THRAP10827 490 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 MAPK10P53779 464 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TMPRSS3P57727 454 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 KIR2DS5Q14953 304 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GPR155Q7Z3F1 870 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GDAP1Q8TB36 358 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 USP7Q93009 1102 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PKP3Q9Y446 797 aa22.68■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 C9orf172C9J069 976 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SLC2A4P14672 509 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SPARCL1Q14515 664 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PRPSAP1Q14558 356 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TGIF1Q15583 401 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 OR10G6Q8NH81 332 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PMEPA1Q969W9 287 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 C5orf60A6NFR6 353 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 OR5K4A6NMS3 321 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 DUX1O43812 170 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PPFIA2O75334 1257 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 BRAFP15056 766 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 CTSCP53634 463 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 UCNP55089 124 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GDF10P55107 478 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TTC13Q8NBP0 860 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PDP2Q9P2J9 529 aa22.66■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PRAMEF1O95521 474 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 METTL18O95568 372 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SLC19A1P41440 591 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 MAPK9P45984 424 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ARSDP51689 593 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 GTF2H3Q13889 308 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ARHGAP40Q5TG30 622 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 ZMYND15Q9H091 742 aa22.65■■□□□ 1.22
PSME4-208ENST00000481518 SMOXQ9NWM0 555 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms