RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-209ENST00000466244 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CCL22O00626 93 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 TP73O15350 636 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 MTX2O75431 263 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 EML2O95834 649 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ITGALP20701 1170 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ACRV1P26436 265 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 MC4RP32245 332 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ACTR1BP42025 376 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 FASLGP48023 281 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 LMAN1P49257 510 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CTSCP53634 463 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ACTR1AP61163 376 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CACNG1Q06432 222 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CBLBQ13191 982 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CAMK2BQ13554 666 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SEPT6Q14141 434 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CCDC38Q502W7 563 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 PERM1Q5SV97 790 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 DHRS13Q6UX07 377 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 IFI44Q8TCB0 444 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 KLK13Q9UKR3 277 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ACP5P13686 325 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 KCNA4P22459 653 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ARNTP27540 789 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 FOXC1Q12948 553 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SQSTM1Q13501 440 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 TCEA2Q15560 299 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 IYDQ6PHW0 289 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 PACS1Q6VY07 963 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 HOOK3Q86VS8 718 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 WDR48Q8TAF3 677 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SERPINB12Q96P63 405 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 BFARQ9NZS9 450 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 ACACBO00763 2458 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB17-209ENST00000466244 B4DGG1 531 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 TCEA3O75764 348 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 F3P13726 295 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 CASQ1P31415 396 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 PAFAH1B1P43034 410 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 PRLHRP49683 370 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 VPS41P49754 854 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 TMPRSS15P98073 1019 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 ITIH4Q14624 930 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 JAMLQ86YT9 394 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.83□□□□□ -0.048e-9■■■□□ 15.2
RAB17-209ENST00000466244 ARL14Q8N4G2 192 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 GATA6Q92908 595 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 HDAC10Q969S8 669 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 COPS8Q99627 209 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 KLC4Q9NSK0 619 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 SYBUQ9NX95 663 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 SOX13Q9UN79 622 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 KCNK6Q9Y257 313 aa14.83□□□□□ -0.04
RAB17-209ENST00000466244 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms