RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	ERP3	Q12403	225 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	ACE2	P21192	770 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	VID27	P40157	782 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	TRM11	Q12463	433 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.3	□□□□□ -1.56	not detected
YNL057W	YNL057W	TFC4	P33339	1025 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	DUR3	P33413	735 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	TGL1	P34163	548 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	GEF1	P37020	779 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	FMP10	P40098	244 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	IOC3	P43596	787 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	IRC8	P47046	822 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	AZR1	P50080	613 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	YMR321C	Q04898	105 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	RKM4	Q12504	494 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	NCB2	Q92317	146 aa		5.3	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	LAM4	P38800	1345 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MAS2	P11914	482 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	DAL5	P15365	543 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	VRP1	P37370	817 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	FLR1	P38124	548 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	REG2	P38232	338 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	YHL050C	P38721	697 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	BRL1	P38770	471 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MID1	P41821	548 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SPO1	P53541	631 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SPH1	Q06160	661 aa		5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SWI6	P09959	803 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	URK1	P27515	501 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SOL3	P38858	249 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	RTS1	P38903	757 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	VPS8	P39702	1274 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	INP52	P50942	1183 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	YGL242C	P53066	181 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	RAD61	Q99359	647 aa		5.28	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SNA3	P14359	133 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	IDI1	P15496	288 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	TIM23	P32897	222 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	TVP23	P38962	199 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	XDJ1	P39102	459 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ARH1	P48360	493 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	KAR5	Q04746	504 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	AI4	P03878	556 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	SEC8	P32855	1065 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	POA1	P38218	177 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	PBY1	P38254	753 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	BDP1	P46678	594 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	MSC2	Q03455	724 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	SUE1	Q06524	206 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	MYO1	P08964	1928 aa		5.26	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	COQ1	P18900	473 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	HEH2	Q03281	663 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	TEL1	P38110	2787 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	NDT80	P38830	627 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	VPS45	P38932	577 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	SPO74	P45819	413 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	CTR1	P49573	406 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	MET13	P53128	600 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	MLC1	P53141	149 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	FOL1	P53848	824 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	YNL034W	P53963	612 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	YNL018C	P53976	612 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	MOT1	P32333	1867 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	PDR18	P53756	1333 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	YIL092W	P40497	633 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	PIB2	P53191	635 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YNL057W	YNL057W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms