RNA–Protein interactions for RNA: YDR261C-D

YDR261C-D, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeast

Gene YDR261C-D, Length 4,815 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YDR261C-D	YDR261C-D	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	ACP1	P32463	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	APE4	P38821	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SPO74	P45819	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MSH6	Q03834	1242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SPC24	Q04477	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	BYE1	P36106	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	KTR4	P38131	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	AIM20	P40451	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	CIN5	P40917	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	HST1	P53685	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	ADA2	Q02336	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MEI4	P29467	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SLX8	P40072	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SLT2	Q00772	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	UBX2	Q04228	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	IVY1	Q04934	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	FYV7	Q12247	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	ESL2	P36168	1195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SWM2	P40342	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SER2	P42941	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MRPL50	P53724	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YDL183C	P48569	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	DID2	P69771	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	NMT1	P14743	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SAP190	P36123	1033 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	FZO1	P38297	855 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	LOH1	P47055	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	BET4	Q00618	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YET3	Q07451	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	TRE2	Q08693	809 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PHO87	P25360	923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	GLG1	P36143	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	AVL9	Q12500	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	RAD27	P26793	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YLF2	P38746	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YIL001W	P40560	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MRX12	P47084	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	RSC1	P53236	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SKM1	Q12469	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PTR2	P32901	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SLX1	P38324	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SPC97	P38863	823 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	TAF4	P50105	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YDR261C-D	YDR261C-D	SPC2	Q04969	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YEL043W	P32618	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	TOM20	P35180	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MIF2	P35201	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PXL1	P36166	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YBR138C	P38277	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YJL070C	P40361	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	CEP3	P40969	608 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MET12	P46151	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	MON1	P53129	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	VPS34	P22543	875 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	ECM25	P32525	599 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	VPS8	P39702	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	GEM1	P39722	662 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	IRC5	P43610	853 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	MNT2	P53059	558 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	IBD2	P53892	351 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	ARP7	Q12406	477 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	APM4	Q99186	491 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	DSF2	P38213	736 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	HDA1	P53973	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	YML119W	Q03208	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	ERP4	Q12450	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	SEY1	Q99287	776 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	HCM1	P25364	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	KCC4	P25389	1037 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	SDS22	P36047	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	LNP1	P38878	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	NUP85	P46673	744 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YDR261C-D	YDR261C-D	MND1	P53102	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.5 ms