RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572085.5

TP53BP1-216, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TP53BP1, Length 5,574 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1-216ENST00000572085 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.92□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.92□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 TNNI2P48788 182 aa11.92□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.92□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 CCDC181Q5TID7 509 aa11.92□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.92□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 GNAI2P04899 355 aa11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 SDF4Q9BRK5 362 aa11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 CDKL5O76039 1030 aa11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 EYA3Q99504 573 aa11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 CETN2P41208 172 aa11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 ZMYND15Q9H091 742 aa11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.9□□□□□ -0.5
TP53BP1-216ENST00000572085 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 TTC16Q8NEE8 873 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 GSTO1P78417 241 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 VEZTQ9HBM0 779 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 COG6Q9Y2V7 657 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 USP47Q96K76 1375 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SLC4A2P04920 1241 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 MAP3K12Q12852 859 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.89□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ANAPC15P60006 121 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 HSPA2P54652 639 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SMARCE1Q969G3 411 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ATP6V1AP38606 617 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 WASF1Q92558 559 aa11.88□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 BIRC2Q13490 618 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 HOOK2Q96ED9 719 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ANKRD62A6NC57 917 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ERLIN2O94905 339 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 NYXQ9GZU5 481 aa11.87□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 KIF4AO95239 1232 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 LIG1P18858 919 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 NLRP3Q96P20 1036 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SMC2O95347 1197 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 PLS1Q14651 629 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 CAGE1Q8TC20 777 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ZNF428Q96B54 188 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 RAB34Q9BZG1 259 aa11.86□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 NESP48681 1621 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 STK38Q15208 465 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 PDCP20941 246 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 NFE2L2Q16236 605 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 PDE6BP35913 854 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 PDILTQ8N807 584 aa11.85□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 GPTP24298 496 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 SAMM50Q9Y512 469 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 IQCA1Q86XH1 822 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.84□□□□□ -0.51
TP53BP1-216ENST00000572085 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms