RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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LATS1-205ENST00000542720 TNS2Q63HR2 1409 aa23.8■■□□□ 1.4
LATS1-205ENST00000542720 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.8■■□□□ 1.4
LATS1-205ENST00000542720 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.8■■□□□ 1.4
LATS1-205ENST00000542720 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
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LATS1-205ENST00000542720 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
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LATS1-205ENST00000542720 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.75■■□□□ 1.39
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LATS1-205ENST00000542720 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.72■■□□□ 1.39
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LATS1-205ENST00000542720 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
LATS1-205ENST00000542720 CYP27B1O15528 508 aa23.69■■□□□ 1.38
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LATS1-205ENST00000542720 SBF2Q86WG5 1849 aa23.67■■□□□ 1.38
LATS1-205ENST00000542720 BCL9O00512 1426 aa23.67■■□□□ 1.38
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LATS1-205ENST00000542720 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.65■■□□□ 1.38
LATS1-205ENST00000542720 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.65■■□□□ 1.38
LATS1-205ENST00000542720 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.65■■□□□ 1.38
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LATS1-205ENST00000542720 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LATS1-205ENST00000542720 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
LATS1-205ENST00000542720 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
LATS1-205ENST00000542720 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.6■■□□□ 1.37
LATS1-205ENST00000542720 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.6■■□□□ 1.37
LATS1-205ENST00000542720 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.6■■□□□ 1.37
LATS1-205ENST00000542720 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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LATS1-205ENST00000542720 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.58■■□□□ 1.37
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LATS1-205ENST00000542720 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.53■■□□□ 1.36
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LATS1-205ENST00000542720 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.52■■□□□ 1.36
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LATS1-205ENST00000542720 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LATS1-205ENST00000542720 BTAF1O14981 1849 aa23.51■■□□□ 1.35
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LATS1-205ENST00000542720 PROM2Q8N271 834 aa23.5■■□□□ 1.35
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LATS1-205ENST00000542720 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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LATS1-205ENST00000542720 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.45■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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LATS1-205ENST00000542720 KCNQ4P56696 695 aa23.42■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.42■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.41■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.41■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 IL17REQ8NFR9 667 aa23.41■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.41■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.41■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 MAP3K5Q99683 1374 aa23.4■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
LATS1-205ENST00000542720 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.4■■□□□ 1.34
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