RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 BEGAINQ9BUH8 593 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 RSPH6AQ9H0K4 717 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 TTLL8A6PVC2 850 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 FDX1P10109 184 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 RETREG3Q86VR2 466 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDRGK1Q96HY6 314 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 KDM4CQ9H3R0 1056 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCDHGC3Q9UN70 934 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MOXD2PA6NHM9 499 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 LILRB3O75022 631 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 JUNDP17535 347 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MTMR2Q13614 643 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SH3D19Q5HYK7 790 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MYSM1Q5VVJ2 828 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PPP2R2DQ66LE6 453 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 TBC1D2Q9BYX2 928 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 TLL2Q9Y6L7 1015 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PLEKHG3A1L390 1219 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPR25O00155 361 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SOCS7O14512 581 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTPRNQ16849 979 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MICALL1Q8N3F8 863 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 HLA-CQ95604 372 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZBTB3Q9H5J0 574 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACSS3Q9H6R3 686 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZFAND3Q9H8U3 227 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 GSC2O15499 205 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 NDUFV2P19404 249 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 HRCP23327 699 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 CLK2P49760 499 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 GUCA2AQ02747 115 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPRNQ4KMQ1 711 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 LYPD8Q6UX82 237 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MPNDQ8N594 471 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM117AQ9C073 453 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 EVA1BQ9NVM1 165 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 LIMD1Q9UGP4 676 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 C6orf229H3BNL8 230 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 F12P00748 615 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCNYL3P0C7X3 344 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 KCNH2Q12809 1159 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRR7Q8TB68 274 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUDT12Q9BQG2 462 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 CFAP99D6REC4 459 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NEUROD2Q15784 382 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM259Q4ZIN3 620 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 BANK1Q8NDB2 785 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 APBA3O96018 575 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 CD97P48960 835 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PKN1Q16512 942 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 QPCTQ16769 361 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 ARMC2Q8NEN0 867 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 CABLES1Q8TDN4 633 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 EDARADDQ8WWZ3 215 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 ITPKCQ96DU7 683 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 POLR3EQ9NVU0 708 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 MX2P20592 715 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 VARSP26640 1264 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 RFC5P40937 340 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 SH3BP2P78314 561 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 CTDSPL2Q05D32 466 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDXDC2PQ6P474 469 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 FOXR1Q6PIV2 292 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 MEIOBQ8N635 442 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF511Q8NB15 262 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDK15Q96Q40 435 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms