RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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SMIM20-202ENST00000514384 EVA1CP58658 441 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 KIF1AQ12756 1690 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA0232Q92628 1395 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.98□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.97□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 STK26Q9P289 416 aa9.97□□□□□ -0.81
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.97□□□□□ -0.81
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SMIM20-202ENST00000514384 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 DAPK1P53355 1430 aa9.96□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 PEAK1Q9H792 1746 aa9.95□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 ST18O60284 1047 aa9.94□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 NEFLP07196 543 aa9.94□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 ITGAEP38570 1179 aa9.94□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 TONSLQ96HA7 1378 aa9.93□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 USP19O94966 1318 aa9.93□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 ABHD8Q96I13 439 aa9.93□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.93□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.93□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 SBF2Q86WG5 1849 aa9.92□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.92□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 FOXN1O15353 648 aa9.91□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.9□□□□□ -0.82
SMIM20-202ENST00000514384 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 DDB1Q16531 1140 aa9.9□□□□□ -0.82
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SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.9□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.89□□□□□ -0.83
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SMIM20-202ENST00000514384 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.89□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.88□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 PAPPAQ13219 1627 aa9.88□□□□□ -0.83
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SMIM20-202ENST00000514384 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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SMIM20-202ENST00000514384 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.86□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.86□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.86□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.86□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC37A3O60309 1634 aa9.85□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 KCNQ4P56696 695 aa9.85□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.84□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.84□□□□□ -0.83
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SMIM20-202ENST00000514384 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 CLTCL1P53675 1640 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 SOX12O15370 315 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 LBX1P52954 281 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 EMP3P54852 163 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 ROCK1Q13464 1354 aa9.83□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 RIMBP2O15034 1052 aa9.82□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 RRAGCQ9HB90 399 aa9.82□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 NUP155O75694 1391 aa9.81□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.81□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.81□□□□□ -0.84
SMIM20-202ENST00000514384 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.81□□□□□ -0.84
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