RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476564.5

MTERF4-215, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

TSL 2

Gene MTERF4, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-215	ENST00000476564	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	AFF2	P51816	1311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	APAF1	O14727	1248 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	ITGB4	P16144	1822 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	IL2RB	P14784	551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	EVA1C	P58658	441 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	USP21	Q9UK80	565 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	EP400	Q96L91	3159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MTERF4-215	ENST00000476564	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	BCL9	O00512	1426 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	NEFM	P07197	916 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	IL16	Q14005	1332 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	CYP27B1	O15528	508 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	PHKG2	P15735	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	RIPK4	P57078	832 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	USP35	Q9P2H5	1018 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	BTAF1	O14981	1849 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	C5	P01031	1676 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	RGS12	O14924	1447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564		E9PSI1	815 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	DDB1	Q16531	1140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	MCM10	Q7L590	875 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	LY75	O60449	1722 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MTERF4-215	ENST00000476564	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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