RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.54■■□□□ 1.36
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SH3BP5-203ENST00000408919 DISP2A7MBM2 1401 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-203ENST00000408919 IL2RBP14784 551 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-203ENST00000408919 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-203ENST00000408919 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-203ENST00000408919 RIPK4P57078 832 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-203ENST00000408919 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-203ENST00000408919 GLI3P10071 1580 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 ATRNO75882 1429 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF521Q96K83 1311 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 WWC1Q8IX03 1113 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC27Q2M243 656 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 BARGINQ6ZT62 677 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC37A3O60309 1634 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP5-203ENST00000408919 DCTN1Q14203 1278 aa23.45■■□□□ 1.35
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SH3BP5-203ENST00000408919 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 SPG7Q9UQ90 795 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 CYP27B1O15528 508 aa23.44■■□□□ 1.34
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SH3BP5-203ENST00000408919 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 MCM10Q7L590 875 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 PHKG2P15735 406 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 TNS2Q63HR2 1409 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 IL17REQ8NFR9 667 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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SH3BP5-203ENST00000408919 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-203ENST00000408919 LGR6Q9HBX8 967 aa23.39■■□□□ 1.33
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SH3BP5-203ENST00000408919 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 WDR63Q8IWG1 891 aa23.36■■□□□ 1.33
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SH3BP5-203ENST00000408919 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A0G2JS52 829 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 MYT1Q01538 1121 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-203ENST00000408919 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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SH3BP5-203ENST00000408919 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 SLFN5Q08AF3 891 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 PDE3BQ13370 1112 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 DCAF5Q96JK2 942 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 IL16Q14005 1332 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 ITGB4P16144 1822 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 E9PSI1 815 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF853P0CG23 659 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 MRC1P22897 1456 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 EP400Q96L91 3159 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 IFT57Q9NWB7 429 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5-203ENST00000408919 CFAP44Q96MT7 982 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5-203ENST00000408919 RXRBP28702 533 aa23.26■■□□□ 1.31
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