RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP21Q9UK80 565 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL2RBP14784 551 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPG7Q9UQ90 795 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA2Q08379 1002 aa35.92■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.92■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF521Q96K83 1311 aa35.91■■■■□ 3.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR63Q8IWG1 891 aa35.9■■■■□ 3.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf141Q5JVX7 400 aa35.88■■■■□ 3.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.88■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFF2P51816 1311 aa35.87■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.86■■■■□ 3.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.86■■■■□ 3.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K5Q99683 1374 aa35.85■■■■□ 3.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.85■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 E9PSI1 815 aa35.81■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.8■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCTN1Q14203 1278 aa35.79■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL16Q14005 1332 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCM10Q7L590 875 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLFN5Q08AF3 891 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 BARGINQ6ZT62 677 aa35.76■■■■□ 3.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYH16Q9H6N6 1097 aa35.76■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DISP2A7MBM2 1401 aa35.75■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.74■■■■□ 3.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC5O00471 708 aa35.73■■■■□ 3.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IL17REQ8NFR9 667 aa35.7■■■■□ 3.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP27B1O15528 508 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFT57Q9NWB7 429 aa35.69■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DDB1Q16531 1140 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0G2JS52 829 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYT1Q01538 1121 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEFQ10587 303 aa35.65■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.52■■■■□ 3.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVV-2B6SEH9 535 aa35.52■■■■□ 3.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.51■■■■□ 3.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTBD11A6QL63 1104 aa35.51■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCN11AQ9UI33 1791 aa35.49■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa35.47■■■■□ 3.27
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