RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 IL2RBP14784 551 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 SPG7Q9UQ90 795 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 MEGF6O75095 1541 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 E9PSI1 815 aa25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 USP21Q9UK80 565 aa25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 MAP3K5Q99683 1374 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 SLFN5Q08AF3 891 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 DCTN1Q14203 1278 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 MCM10Q7L590 875 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.2■■□□□ 1.63
SYTL1-201ENST00000318074 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 NRAPQ86VF7 1730 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 IL16Q14005 1332 aa25.19■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 VPS72Q15906 364 aa25.19■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.18■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 AFF2P51816 1311 aa25.18■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 PHKG2P15735 406 aa25.14■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 IL17REQ8NFR9 667 aa25.14■■□□□ 1.62
SYTL1-201ENST00000318074 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.14■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 IFT57Q9NWB7 429 aa25.14■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 GNAI1P63096 354 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 BARGINQ6ZT62 677 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 CYP27B1O15528 508 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 CFAP44Q96MT7 982 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 DISP2A7MBM2 1401 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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SYTL1-201ENST00000318074 LGR6Q9HBX8 967 aa25.11■■□□□ 1.61
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SYTL1-201ENST00000318074 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 DCAF5Q96JK2 942 aa25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF853P0CG23 659 aa25.08■■□□□ 1.61
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SYTL1-201ENST00000318074 TEFQ10587 303 aa25.08■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 DDB1Q16531 1140 aa25.07■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 MBIPQ9NS73 344 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 CHL1O00533 1208 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 A0A0G2JS52 829 aa25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 MYT1Q01538 1121 aa25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 ATRNO75882 1429 aa25.03■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.03■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.03■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 TNS2Q63HR2 1409 aa25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-201ENST00000318074 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
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SYTL1-201ENST00000318074 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 LRRC37A3O60309 1634 aa24.99■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 BTBD11A6QL63 1104 aa24.99■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 CABP4P57796 275 aa24.99■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.98■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.98■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.97■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.95■■□□□ 1.59
SYTL1-201ENST00000318074 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.95■■□□□ 1.58
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