RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.96■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.96■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
SPCS1-201ENST00000233025 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.94■■□□□ 1.42
SPCS1-201ENST00000233025 MSL1Q68DK7 614 aa23.94■■□□□ 1.42
SPCS1-201ENST00000233025 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.92■■□□□ 1.42
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.89■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 CAPN15O75808 1086 aa23.88■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.87■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 USP31Q70CQ4 1352 aa23.87■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.86■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.85■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 TOMM70O94826 608 aa23.85■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.85■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 PRELPP51888 382 aa23.84■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 EVC2Q86UK5 1308 aa23.84■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.83■■□□□ 1.41
SPCS1-201ENST00000233025 JMYQ8N9B5 988 aa23.82■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.82■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.82■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 C4BP0C0L5 1744 aa23.81■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 KLRG1Q96E93 195 aa23.8■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 TNS4Q8IZW8 715 aa23.79■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 USP47Q96K76 1375 aa23.78■■□□□ 1.4
SPCS1-201ENST00000233025 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.76■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 MEGF6O75095 1541 aa23.75■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 HTRA3P83110 453 aa23.75■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.75■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 NME9Q86XW9 330 aa23.74■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.74■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.73■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.73■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 ITGB4P16144 1822 aa23.73■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.71■■□□□ 1.39
SPCS1-201ENST00000233025 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.69■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 IP6K1Q92551 441 aa23.68■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.68■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 PALLDQ8WX93 1383 aa23.67■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPCS1-201ENST00000233025 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.64■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 SLC34A2O95436 690 aa23.63■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 FSTL1Q12841 308 aa23.63■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 AK7Q96M32 723 aa23.62■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.61■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM5Q71RC9 77 aa23.61■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 PHF14O94880 888 aa23.6■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 SBF1O95248 1867 aa23.6■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.59■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.59■■□□□ 1.37
SPCS1-201ENST00000233025 SSFA2P28290 1259 aa23.57■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.57■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 BCS1LQ9Y276 419 aa23.57■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC9P31274 260 aa23.56■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.56■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.54■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PP64 1363 aa23.53■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 TGFB2P61812 414 aa23.53■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 C4AP0C0L4 1744 aa23.53■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 MMP10P09238 476 aa23.52■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.52■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.52■■□□□ 1.36
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JLW4 131 aa23.51■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.51■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.51■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.5■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.5■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF4Q96M43 638 aa23.5■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 RTL1A6NKG5 1358 aa23.5■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.48■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.48■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.48■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 AMPHP49418 695 aa23.47■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.47■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 TMC1Q8TDI8 760 aa23.47■■□□□ 1.35
SPCS1-201ENST00000233025 FCHSD2O94868 740 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms