RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 BAG6P46379 1132 aa23.9■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 PHF12Q96QT6 1004 aa23.9■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 ERBB3P21860 1342 aa23.89■■□□□ 1.42
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC7Q96M83 1385 aa23.89■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 DDB1Q16531 1140 aa23.88■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM212AQ96EL1 285 aa23.88■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 SBF2Q86WG5 1849 aa23.88■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 PEAK1Q9H792 1746 aa23.87■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 IP6K1Q92551 441 aa23.87■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.87■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.87■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM37O94972 964 aa23.86■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 DISP2A7MBM2 1401 aa23.85■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.85■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.84■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.84■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 FBLN1P23142 703 aa23.83■■□□□ 1.41
PLGRKT-201ENST00000223864 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.83■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.83■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 AMPHP49418 695 aa23.82■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.82■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.81■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 EXOC5O00471 708 aa23.8■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 HOXC9P31274 260 aa23.8■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 APBA3O96018 575 aa23.79■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 RTL1A6NKG5 1358 aa23.78■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 IL2RBP14784 551 aa23.77■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.77■■□□□ 1.4
PLGRKT-201ENST00000223864 BCL9O00512 1426 aa23.76■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 TNS2Q63HR2 1409 aa23.76■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.76■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.76■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.76■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 RREB1Q92766 1687 aa23.74■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.74■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.74■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 PYGBP11216 843 aa23.73■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 GSE1Q14687 1217 aa23.73■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.73■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF12Q96FN5 646 aa23.71■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 PANK3Q9H999 370 aa23.71■■□□□ 1.39
PLGRKT-201ENST00000223864 INSRP06213 1382 aa23.7■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 FLT4P35916 1363 aa23.7■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.69■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 GABBR2O75899 941 aa23.68■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.68■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 NHSQ6T4R5 1651 aa23.67■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 PLSCR1O15162 318 aa23.66■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.66■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.66■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF4Q96M43 638 aa23.66■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.66■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K13O43283 966 aa23.65■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.64■■□□□ 1.38
PLGRKT-201ENST00000223864 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.63■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 NSD2O96028 1365 aa23.62■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.61■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 MEGF6O75095 1541 aa23.61■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 POLKQ9UBT6 870 aa23.61■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 BTAF1O14981 1849 aa23.61■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNQ2O43526 872 aa23.59■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 NBPF14Q5TI25 921 aa23.59■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.59■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.58■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.58■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 MS4A3Q96HJ5 214 aa23.58■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.58■■□□□ 1.37
PLGRKT-201ENST00000223864 LRP5O75197 1615 aa23.57■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.56■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 NCAPD2Q15021 1401 aa23.54■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 MORC1Q86VD1 984 aa23.53■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPC6Q9Y210 931 aa23.53■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.53■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PLGRKT-201ENST00000223864 TXNRD1Q16881 649 aa23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.1 ms