RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GPAMQ9HCL2 828 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF302Q9NR11 478 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SAR1AQ9NR31 198 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 VPS28Q9UK41 221 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CORINQ9Y5Q5 1042 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 AUP1Q9Y679 476 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NFASCO94856 1347 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KBTBD13C9JR72 458 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 J3QRK9 145 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CTDSP2O14595 271 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HCRTR2O43614 444 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 NFKB1P19838 968 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ARNTP27540 789 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PIK3R1P27986 724 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CXCR5P32302 372 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EPHX2P34913 555 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GPC1P35052 558 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SCNN1AP37088 669 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 KIR3DL2P43630 455 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CLCN5P51795 746 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CLCNKBP51801 687 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GTF2BQ00403 316 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BTKQ06187 659 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC3A1Q07837 685 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 STRN3Q13033 797 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GRM7Q14831 915 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DLG2Q15700 870 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00523Q86TU6 105 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SLC43A2Q8N370 569 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ATP2A3Q93084 1043 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FBXL8Q96CD0 374 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC39Q96DD0 335 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PGM2Q96G03 612 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 APOPT1Q96IL0 206 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 EDEM2Q9BV94 578 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DMAC2Q9NW81 257 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TBX20Q9UMR3 447 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 A8MUA0 341 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF197O14709 1029 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF185O15231 689 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 APOA1P02647 267 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CYP11A1P05108 521 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 FCER2P06734 321 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PRF1P14222 555 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PFKLP17858 780 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TNNI1P19237 187 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CYP2A7P20853 494 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 MMP8P22894 467 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 S100PP25815 95 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TIE1P35590 1138 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LIG4P49917 911 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HUNKP57058 714 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ADAM15Q13444 863 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF273Q14593 569 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PTPRRQ15256 657 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 METTL23Q86XA0 190 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 GALNT12Q8IXK2 581 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TIGD4Q8IY51 512 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HIPK4Q8NE63 616 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 HDAC10Q969S8 669 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 COPS4Q9BT78 406 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-201ENST00000325897 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms