RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409915.8

SF3B1-202, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF3B1, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-202ENST00000409915 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CASP10Q92851 521 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CHFRQ96EP1 664 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 HPDLQ96IR7 371 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 VPS39Q96JC1 886 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MED15Q96RN5 788 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 ATP6V0BQ99437 205 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.6□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 DPH1Q9BZG8 443 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MIS12Q9H081 205 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 S1PR5Q9H228 398 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 C1orf21Q9H246 121 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CHST8Q9H2A9 424 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 POMKQ9H5K3 350 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 OPA3Q9H6K4 179 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 WDCPQ9H6R7 721 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SMYD3Q9H7B4 428 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 INIPQ9NRY2 104 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 STK39Q9UEW8 545 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 USP18Q9UMW8 372 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CCL27Q9Y4X3 112 aa4.6□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 NME7Q9Y5B8 376 aa4.6□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 A0A1W2PQ09 198 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 C7orf72A4D263 438 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MTMR11A4FU01 709 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 C2orf81A6NN90 581 aa4.59□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 E7EVH7 732 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 H7C4K7 107 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 DLL1O00548 723 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 STX16O14662 325 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 KLK10O43240 276 aa4.59□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 AHSGP02765 367 aa4.59□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 HEXBP07686 556 aa4.59□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 UBL4AP11441 157 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 VAV1P15498 845 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 EGR1P18146 543 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 TYMPP19971 482 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MALP21145 153 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 ATP6V1C1P21283 382 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CALB2P22676 271 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 FPR2P25090 351 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 LMO2P25791 158 aa4.59□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 PNPLA4P41247 253 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 GPR15P49685 360 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MXI1P50539 228 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CDH8P55286 799 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 GNGT1P63211 74 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MXRA7P84157 204 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 ZBTB16Q05516 673 aa4.59□□□□□ -1.67
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SF3B1-202ENST00000409915 STX1AQ16623 288 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 MAN2A1Q16706 1144 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 NDUFA5Q16718 116 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 AAK1Q2M2I8 961 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 CBWD6Q4V339 395 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.59□□□□□ -1.67
SF3B1-202ENST00000409915 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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