RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592444.5

ERCC1-216, Transcript of ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit, human

TSL 2

Gene ERCC1, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC1-216	ENST00000592444	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MED25	Q71SY5	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PDILT	Q8N807	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DHX58	Q96C10	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BICD1	Q96G01	975 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ASB7	Q9H672	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SEC16A	O15027	2179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HCFC1	P51610	2035 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IKBKB	O14920	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CLIC2	O15247	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TBL1X	O60907	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NDUFA10	O95299	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TPO	P07202	933 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PYGM	P11217	842 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BRAF	P15056	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ACOT2	P49753	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NUMB	P49757	651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NDST2	P52849	883 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RRAD	P55042	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	STK4	Q13043	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SGCG	Q13326	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NR1D2	Q14995	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	STX1A	Q16623	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	NR4A3	Q92570	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC1-216	ENST00000592444	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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