RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 PYGLP06737 847 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GNPDA1P46926 289 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 POLD2P49005 469 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 MARCKSL1P49006 195 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GALNT3Q14435 633 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ISXQ2M1V0 245 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX44Q53QW1 395 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 DOK6Q6PKX4 331 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 NLRP8Q86W28 1048 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR48Q8TAF3 677 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 AGAP2Q99490 1192 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SUFUQ9UMX1 484 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ZZEF1O43149 2961 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RCCD1A6NED2 376 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 NOBOXO60393 691 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 MPOP05164 745 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 IVLP07476 585 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPN3P26045 913 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY2Q08462 1091 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SPIDRQ14159 915 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PCSK7Q16549 785 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM74Q86UV6 250 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 EXD1Q8NHP7 514 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT35Q92764 455 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 P3H4Q92791 437 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 HIC2Q96JB3 615 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GLOD4Q9HC38 313 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 LHX6Q9UPM6 363 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 INPP4BO15327 924 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ACTN2P35609 894 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SPINT3P49223 89 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GABREP78334 506 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK18Q07002 472 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC14A2Q15849 920 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 NRROSQ86YC3 692 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 FGF11Q92914 225 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TADA1Q96BN2 335 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 HAUS1Q96CS2 278 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TEKT5Q96M29 485 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIB3Q96RU7 358 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A087WV48 116 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 MTSS1O43312 755 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 GLB1P16278 677 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY8P40145 1251 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 LSSP48449 732 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 CCL7P80098 99 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 CTBSQ01459 385 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-211ENST00000493436 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms